Регион находится в лесной зоне, в подзоне южной тайги, переходящей в широколиственно-тёмнохвойные леса на северо-западе и массивы сосновых лесов в северной и юго-западной частях. Леса (ель, сосна) занимают около половину территории области. Леса занимают 4,5 млн. га (около 2,0 млн. га хвойных пород), или 53 % от общей площади области. Болота занимают около 7 % от общей площади области. Крупнейший природоохранный объект — Центрально-лесной биосферный заповедник на территории Нелидовского и Андреапольского районов. Заповедник основан в 1931 году, занимает площадь 21 тыс. га.